Ursprünglicher Träger des Vincentius-Krankenhauses war die Vincentius-Krankenhaus AG. Schon im vorletzten Jahrhundert am 15. Mai 1885 wurde die Aktiengesellschaft St. Vincentius-Verein gegründet.

Das fertig gestellte Haus neben dem alten Schottenfriedhof und die Kapelle wurden am 03. Dezember 1888 feierlich eingeweiht.

Während des 1.Weltkrieges diente das Haus als Lazarett für verwundete Soldaten. 1926 waren sieben Belegärzte tätig, die 560 Patienten betreuten.

Nach der Neuordnung des Begriffs der Gemeinnützigkeit wurde dem Krankenhaus am 16. Dezember 1941 die Steuerfreiheit zugesprochen. Die Aktiengesellschaft trägt bis zum heutigen Tage die Bezeichnung “gAG”, wobei das kleine “G” für gemeinnützig steht.

Nach dem Zweiten Weltkrieg folgten Jahre der Anschaffung medizinischer Einrichtung und Erneuerung verschiedener Räumlichkeiten. Ende Mai 1975 konnte ein Neubau der Vincentius AG übergeben werden. Immer mehr entwickelte sich das Haus entsprechend der großen Nachfrage zur Fachklinik für Orthopädie mit dem Schwerpunkt Endoprothetik.

1990 wurde der Altbau aus dem Jahr 1885 zur Rehabilitationsabteilung umgebaut und ermöglicht nun eine vernetzte Betreuung und Therapie zwischen operativer Orthopädie und Rehabilitation (neudeutsch: Integrierte Versorgung).

Um dringend notwendige medizinische Einrichtungen mitzufinanzieren wurde am 01. Juni 1993 der Verein zur Förderung, Erhaltung und zum medizinischen Ausbau des Vincentius-Krankenhaus Konstanz e.V. gegründet. Diesem Verein haben sich zwischenzeitlich ca.280 Mitglieder angeschlossen.

1996 wurde die orthopädische Klinik als zweites Krankenhaus in Deutschland nach der DIN EN ISO 9001 zertifiziert. 1999 folgte erstmalig in Deutschland im Krankenhausbereich die Wiedererlangung dieses Zertifikats.

2013 erfolgte die Eingliederung in den Gesundheitsverbund Landkreis Konstanz (GLKN). Im März 2018 erfolgte der Umzug des Vincentius Krankenhauses in das neue Funktionsgebäude am Klinikum Konstanz. Die Namensänderung zu Vincentius Orthopädische Fachklinik erfolgte zeitgleich mit dem Umzug in die neuen Räumlichkeiten.